江晓独自开着船在海面上而到达了一座海岛，在这里有很多的珍珠贝，江晓顺手捕捉了两只。
随后江晓便展开了收海中的神奇宝贝，却在岛上遇见了一只漂浮泡泡，江晓顺手捕捉了。
在随后江晓捕捉了一只体型比同类还要大上几分的吼吼鲸，江晓意外发现一只海豹球同样捕捉。
发现跳跳猪也捕捉，长翅鸥与溜溜糖球同样捕捉随后寻找到了一只爱心鱼一同捕捉在捕捉了这几只之后。
江晓出发前往三岛三座岛屿有不同，很快江晓到达岛上，在这里遇见了小田卷博士。
帮忙一同调查，在这里的神奇宝贝的不同，江晓先是来到了神奇宝贝中心将手中的神奇宝贝更换为珍珠贝。
随后来到第一个岩洞，在那里面将珍珠贝放入水中，在等待中一直观察结果珍珠贝进化为猎斑鱼。
江晓将手放入水中，一阵摸索之后果真找到了一枚深海之牙，第一个岩洞的秘密发现了。
很快江晓来到第二个岩洞，也将珍珠贝放入水中观察着很快闪起了一道白光珍珠贝进化为樱花鱼。
江晓在水中寻找发现了深海鳞片，随后江晓将结果告诉小田卷博士，而后小智他们也来到了岛上。
在调查了之后发现了很多的秘密，江晓做出了一个胆大的猜测，这深海之牙与深海鳞片出现了洞穴。
会不会是很早之前某只神奇宝贝的洞穴，常年居住所遗留的鳞片，或者是源头拥有很多的鳞片，随着那一道水柱流了下来。
在一番猜测后得到的结论，随后小田卷博士做了一个决定，留下来观察而小智他们去赶忙搭船。
江晓无语的开着船离开了岛，而后，江晓寻找了一座岛训练了一番神奇宝贝。
突然之间接收到听雪楼消息，水舰队与火岩队又有了新的动作，火岩队而这次赤焰松亲自带队。
水舰队也传来了新的消息水梧桐，亲自带队带走了很多的水舰队成员，看样子是有大动作。
而这一消息让江晓没办法平静，赶忙寻找到了一神奇宝贝中心，连忙拨通了大木博士。
在拨通的那一瞬间，江晓非常严肃的对大木博士说，情况紧急更换神奇宝贝。
远古快龙江晓现在还带在身边，江晓将洛奇亚，以及老鬼远在喷火龙山谷岛返祖的喷火龙与超梦也带上。
其他的江晓都没有带，而江晓已经猜到了水舰队与火岩队这次的大动作目的。
因为他还记得一点点自己看的动漫，虽然自己的混入，但自己没有把时间线打的太乱。
所以没有太多超过自己意料之外的事，这便是江晓平时不和小智他们一起走的原因。
如果将时间线打得太乱，自己都没办法理清，那么，后面将会发生一些自己意想不到的事或一些事，发生的连自己都无法察觉。
那样自己就失去了有利的形势，江晓可不想让自己落入被动的局面，再将神奇宝贝全部更换了之后，带上五只神奇宝贝便出发了。
很快来到了梦斯岛附近，而这次十二生肖出动五名，十二星座同样出动五名渡天王已经潜入火岩队。
而十二生肖的五名成员负责对付火岩队，十二星座的五名成员，其中一名潜入水舰队。
而江晓来到了这里后询问情况，后得知现在的情况很不乐观。
水舰队已经抓住了固拉多，火岩队已经抓住了盖欧卡，现在双方被挟持着在这里谈判交换。
格斗天王希巴，带着一个青年走了过来，青年便介绍自己隐氏家族之一君家嫡系。
而后青年便向，江晓介绍起了自己他们家族将整个家族隐藏了起来唯一能够露面的，只有家族的女子。
那就是世界各地的君莎小姐，他们家族的任务看守大地宝珠，家族中所有的女子会被分配到各地担任警察。
所有的男子统一，接受严格的训练，而后在家族企业内保护珠子，但却遭受到了火岩队的偷袭。
将大地珠子抢走了，同样另一个隐士家族乔家，也遭受了水舰队的迫害，他们家的珠子被水舰队偷走了。
对于这种情况江晓也说了，自己会尽力，随后让希巴派人把他送到，送走尽快远离这里。
青年很不解，江晓说道这里很可能很快就会发生战斗，随后希巴带人将青年送走。
而火岩队派人潜入水舰队，两位成员通通被抓，水舰队则派出了首席战斗队长潜入火岩队。
很快混入关押盖欧卡的关押室，将盖欧卡从里面放了出来，而后火岩队受到攻击。
在受到攻击的那一刻，蓝色珠子脱手而出，皮卡丘跳了起来去抢夺大狼犬去捉皮卡丘。
聪明的皮卡丘借用大狼犬的脑袋去捉那颗蓝色珠子，皮卡丘抱住了蓝色的珠子。
但很快珠子慢慢的融入了皮卡丘体内，皮卡丘陷入了狂暴状态，而在场的所有神奇宝贝，没有一只是皮卡丘的对手。
小智等人看见这时机很好就逃了出去，小刚小遥小胜跳到了水里，小智还在担心皮卡丘结果被捉住了。
随后被关了起来，赤焰松与水梧桐在岛上会面，但因为固拉多还被关着盖欧卡已经被放了出来。
赤焰松已经没有任何的优势，水梧桐自然而然的没有答应，放固拉多还扬言会毁灭所有人。
没想到火箭队三人组也到达这里，已经跑到了水舰队的船上捣乱，却意外将盖欧卡放了出来。
随后皮卡丘通过飞船破掉的那个洞钻了出来，来到了关固拉多的那个大仓库。
释放雷电引出一道雷霆击中了固拉多，仓库被雷电打坏后固拉多出来了，两只神奇宝贝引起了天灾。
还在奔腾海啸与海龙卷齐出，梦斯岛火山喷发，江晓命令道所有人进攻盖欧卡。
所有的人放出了飞行系神奇宝贝乘坐上去去对付盖欧卡，而江晓的目标对付固拉多。
江晓将快龙 老鬼 洛奇亚 超梦 喷火龙放了出来让快龙 洛奇亚对付固拉多，剩下的拖住盖欧卡