卡欧斯巴格，原本是在群马县·萤火虫村的非法垃圾堆中的废弃金属垃圾部件，受到混沌之首的光之病毒附着影响，这些本是无机物的金属零件（如螺丝钉等）成为了发出荧光的、会活动的“生命体”，看起来就像是一群萤火虫。当发现机动车等会发出热量的物体时便会蜂拥而上，吸收能量并将整个金属车身消灭。 卡欧斯巴格在萤火虫村作案数次，引来了tEAm EYES的调查，卡欧斯巴格依旧以小型荧光体的姿态出现，更袭击了春野武藏和风吹圭介乘坐的谢巴德巡逻车；好在武藏发现了卡欧斯巴格的目的只在于袭击发出热量的物体，车子熄火后便退散而去，两人逃过了一劫。EYES为对付卡欧斯头部而出动泰克雷霆1号赶到现场，卡欧斯巴格的所有小型个体聚集起来，故意被战斗机的镭射光打中，吸收能量后实体化成为了巨大怪兽。 卡欧斯巴格对萤火虫村进行大肆破坏，更强行吸收泰克雷霆战斗机的能源，让情况陷入危境。武藏变身为高斯奥特曼登场，解救了泰克雷霆，并与卡欧斯巴格交战。但卡欧斯巴格的无机物身体，加上能源吸收能力，直接无效了高斯月神模式的「月神抽取」的净化光线并吸收掉，更以破坏光束压倒了月神模式。高斯愤而切换为日冕模式迎战，压制了卡欧斯巴格。最后，高斯日冕使出必杀技「内巴斯特光线」，在热量、能源和破坏力上完全超过了卡欧斯巴格的吸收上限，最终击杀了卡欧斯巴格，将其彻底炸碎消灭。
梦幻魔兽因休拉斯，真实身份是诺瓦尔星人为了探知人类的精神世界而派来的魔兽，利用催眠的极光让人陷入浅层睡眠后不断做梦，将产生的脑波吸收作为自身能源的同时，也借此分析人类的记忆数据，让诺瓦尔星人进一步了解地球人类。 因休拉斯在一夜之间，就让包括tEAm EYES的绫乃队员在内的35人一直陷入沉睡中。尽管EYES调查后发现了梦境中出现的小型因休拉斯，但却还是无从下手。春野武藏借助高斯奥特曼的力量穿越到绫乃的梦境之中，打算帮绫乃脱困。但小型因休拉斯发现了闯入者的存在，变换梦境翻弄武藏，随后所有的小型体融合变化，现出了因休拉斯的真身，和高斯奥特曼·月神模式展开对决。 一开始，因休拉斯凭借着对梦境的掌控，以及自身的超能力加持，压制了高斯月神模式。但在绫乃队员的活跃下，高斯从圆顶之星的束缚下脱困，形势顿时逆转。高斯切换为日冕模式重创了因休拉斯，最后使出「日珥球」将其击杀。因休拉斯被消灭，其编织的梦世界也瓦解，沉睡的人们也平安苏醒。
怪兽猎人·诺瓦尔星人，居住在J34星系的诺瓦尔星上的宇宙人，拥有高度发达的科学技术和高等的智慧。诺瓦尔星人的思维理性而又贪婪，将怪兽作为生物资源利用，在自己母星上大规模捕获怪兽后并加以改造、驱使，得以构筑了各种各样的文明。但由于高强度的捕获，以及残酷的改造和驱使，导致诺瓦尔星上的怪兽最后灭绝。诺瓦尔星人寻找有怪兽栖息的星球，来补充母星所需的怪兽资源，一番寻觅后，诺瓦尔星人向地球袭来。 一开始，诺瓦尔星人派出梦幻魔兽因休拉斯进入人们的梦境盗取人类的记忆资料，又派遣催眠魔兽拉古斯东对人类的欲望进行调查，虽然都被高斯奥特曼挫败，但也是颇有成效。不久后，诺瓦尔星人展开了自己的计划。 诺瓦尔星人先是捕获了地底怪兽太尔达斯和岩石怪兽尼尔德蓝特进行机械改造，接着，其中一个诺瓦尔星人还化身为人类的模样和春野武藏进行接触，向其阐明自己的计划，希望能和武藏（高斯奥特曼）达成共识。但是诺瓦尔星人对怪兽的改造科技残酷无情，导致怪兽们大都因为生理排斥反应而死亡，这让爱护生命的武藏不能接受，于是谈判破裂，诺瓦尔星人想杀死武藏，但被赶来的风吹队员阻止，最后被击毙。而其他的诺瓦尔星人暂时偃旗息鼓，继续在地球潜伏。 后来潜伏许久的诺瓦尔星人，在得知tEAm EYES获得了拥有控制时间流能力的怪兽阿拉多斯之后，出面和青年精英队（tEAm EYES）进行交涉，以自己撤出地球为理由，想得到阿拉多斯，但鉴于其过往行径而遭到EYES和地球防卫军的拒绝。于是，诺瓦尔星人直接武力抢夺，驾驶宇宙船来抓阿拉多斯，但被EYES阻挠，便放出怪兽拉古斯东·机械改装型，和怪兽配合着对EYES发动攻击。 春野武藏变身为高斯奥特曼登场，以日蚀模式压制住了拉古斯东·机械改装型。此时，诺瓦尔星人驾驶宇宙船展突入战场，用飞船的破坏光线联合拉古斯东的冲撞攻击，将高斯（日蚀模式）逼入绝境。危急时刻，阿拉多斯用尽最后的力量将拉古斯东送到时空彼岸；而诺瓦尔星人失去了怪兽助力，最终被高斯的「日蚀之刃」毁灭了宇宙船，诺瓦尔星人在爆炸中全灭。
童心妖怪·山童，从古时候起就生活在山妾罗倭山脉（山童山）的妖怪·古代兽，性格温厚善良，讨厌寂寞，喜欢和小孩玩耍。由于自身保护色能力的原因，只有小孩子才能看见他，大人看不见，因此将山童描述为“只有孩子般纯粹的心灵才能看见的妖怪”，成为中部地区的民间传说。通常是和人类相当的大小，感情高涨时便会巨大化变身。 山童曾在20年前和少年时期的岩田康佑结为朋友，在岩田康佑搬家时将“山童之泪”作为友情之证赠予岩田康佑。20年后，山童为了找寻朋友而下山，偶遇了岩田康佑的儿子·岩田佑一，并和佑一成为朋友。在知道佑一要被父亲带走时因愤怒而巨大化，追踪岩田康佑的车辆，遭到tEAm EYES（青年精英队）的战斗机的威慑攻击而暂时消失。不久后，山童在山林里找到了再次迷路且受伤的岩田佑一，将其带到山上保护。EYES进行搜索救援时找到了佑一的位置，山童误认为EYES想要伤害佑一而再次巨大化，攻击泰克雷霆战斗机，并和春野武藏变身的高斯奥特曼展开战斗。 山童凭借狂野的战斗方式压制了高斯的月神模式，但很快就被模式变换的高斯用日冕模式击倒，短暂失去战斗力。这时候，岩田康佑拿出“山童之泪”，山童认出岩田康佑就是当年分别的朋友，想邀请岩田康佑和自己一起玩耍，但岩田康佑以自己作为成年人的责任为由婉拒了山童，并和山童所代表的童年生活告别。悲伤的山童消失在了山林之中。 后来耐不住寂寞的山童再次下山，因为误入货车内而被带到了奥日高村，和当地的孩子们结交为朋友，一起开心地玩耍。在古代时，山童曾造访奥日高村，封印了为祸一方的传说恶鬼马哈格诺姆，在当地留下了“妖怪大人”的传说，山童当时封印马哈格诺姆的地方也建立起祠堂，用来镇压马哈格诺姆。 就在山童来到奥日高村的几乎同一时间，封印用的祠堂因道路工程而被毁，导致马哈格诺姆重见天日，在当地进行疯狂破坏。山童为了保护新结交的朋友们而巨大化，再次和宿敌马哈格诺姆战斗。这次的战斗，山童不是马哈格诺姆的对手，幸好高斯奥特曼及时出手帮助，压制了马哈格诺姆。山童趁马哈格诺姆筋疲力竭的时候，施展出名为「祭神舞乐」的封印之舞，将马哈格诺姆再次封印。完成封印后，山童和孩子们道别，再次回归森林之中。