柯南与服部赶到了横滨海洋大学，却意外在这里看见了同样带着Id手环的白马探。不过这位白马探其实是怪盗基德伪装的，手环也是偷了园子的。
得知“cRY”是指“横滨犯罪研究社”后，三人搭伙前往了社团的活动教室。
委托人又一次打来电话，这次居然是什么线索都没给，这让服部平次很无语。
在从社团成员那里套话之后，几人知晓了没有悬挂相框的那位社长就是第三代的社长伊东末彦。
服部平次立刻表现了一番标准的官二代做法，立刻给大阪府的警察总部打电话拜托大泷警官调查。同时希望这件事能对他爹保密。但大泷警官光速被远山警部钓鱼，随后服部平藏也知道了这件事。
此时在游乐园内，目暮警部和白鸟警官已经开始在暗中保护小兰他们了，千叶警官也去把可能会有危险的超级巨蛇项目关停了。
小兰注意到了医务室外的目暮警部，准备去打个招呼，三小只这边则坐不住想要出去玩了。灰原拦不住他们，慈善家就主动出门了：“放心，我会看好他们。”原生信徒和爱哭鬼也跟在后面出去了。
几个孩子跑到超级飞蛇项目那里，却发现项目已经关停了，只好失望离去。而一位排队取号的女士的手提包却被飞奔而来的小偷抢走了。元太的可乐被撞翻在地，泼到了小偷的鞋子上。
视角回到柯南这边，在与白马探交流情报后他们得知，伊东末彦是抢劫运钞车的重大嫌疑犯，目前正被警方通缉。而他开设的一家投资顾问公司也发生了一起杀人案，被杀的人是伊东末彦的大学同学兼公司营业部长西尾正治。几人就决定去那家公司看看。
毛利小五郎这边，走投无路的他只好求妃英理帮忙收集资料，而妃英理非常有默契地知道了丈夫的困境，立刻给他提供了资料。
在案发的公司内部，三人查看相片后，另一个人，清水丽子进入了他们的视线，但她似乎已经自杀了。
查看完案发现场，柯南与服部心中有了定论，他们却在此时遭到了袭击。两个摩托车杀手直接开车上楼要攻击三人，三人直接分头逃命。
服部平次操起一根钢管，本想与其中一个来一场堂堂正正的武士对决，但对面不讲武德掏出了枪，服部平次只好趁着换弹的时机逃出门去卡了一波视野反绕回来。
柯南这边，他先是一脚足球踢倒了油漆罐困住歹徒，然后脚踩滑板车逃出了建筑，最后在逃离追捕时不幸摔伤了腿，掉入河中。
乐园这边，小兰和和叶一组，慈善家和孩子们一组，两组人正分头寻找着混在人群里的小偷，侦探团众人依靠元太洒在小偷鞋上的可乐锁定了目标。
在追逐小偷的过程中，光彦用扫把绊倒了小偷，随后元太补上了一记肘击，把小偷撞倒在地。
爬起来的小偷试图对小兰动手，但小兰是空手道高手，三拳两脚就把小偷击退，小偷扭头又想对和叶动手，和叶不遑多让，一个过肩摔把小偷摔了回去。但万万没想到把小偷摔到了爱哭鬼身边。
小偷立马用胳膊夹起爱哭鬼，掏出刀子威胁众人。
[慈善家：啊啊啊啊啊！罗比！我这就来救你！]
[小女孩：糟了，罗比脖子上的缝线，不会在这时候断开吧！]
[爱哭鬼：我没事！但是不能在这里使用鬼火......]
在众人一筹莫展的时候，原生信徒悄悄抓起地上的扫把，靠近了小偷。
“放下我的朋友！”原生信徒狠狠地抡起扫把砸向小偷的双腿。
小偷一个踉跄放开了爱哭鬼，爱哭鬼迅速跑开了。小偷刚想回头针对这个敢打他的脚的小姑娘，却看见原生信徒背后升起一个扭曲的鬼影：一个硕大的女人的头，一双没有瞳孔的眼睛，漆黑如墨的长发垂下，发间似乎还埋藏着许多相同面容的女人的脸，长在身侧的不知道有几双的手臂缓缓抬起，一条蛇一样的尾巴硬生生拼接在下半身，缓缓蠕动着。
这恐怖的场面吓得他立马往另一边逃跑了。
随后这个倒霉蛋因为劫持到了陪高木警官来这里度假的佐藤警官，被一记抱摔彻底Ko。
[梦之女巫：哼，哪来的爬虫，敢那样看着我的信徒？]
[原生信徒：让吾主费心了。]
[梦之女巫：你做得很好，好孩子。]
[慈善家：女巫大人威武，讲真，看见那个形象我也差点被吓到。（擦汗）]
[小女孩：还好其他路人看不到呢。]
[爱哭鬼：对不起，要不是我不小心被抓住......]
[慈善家：不，罗比，要不是我没有保护好你......]
[小说家：好了好了，还好最后没出什么事。我这边可算是把掉河里的柯南捞出来了。]
“柯南，醒醒！”小说家摇晃着柯南。
醒来的柯南看到了身边的小说家和服部平次。
“这里是阿笠博士的车上，那位叫白马探的侦探通知了阿笠博士，我也刚好获得情报赶来了这里。”小说家耐心地向柯南解释。
服部平次补充：“另外，我这边有新的情报。西尾被杀那天，码头发生了车祸，车上坐着的就是伊东末彦，他因为受了相当严重的伤在医院躺了有一个月。警方调查那辆车发现油压管被人动了手脚，后备箱里则有一把狙击枪。”
“看起来像是在杀人灭口。”小说家分析道。
“那伊东末彦被逮捕了吗？”柯南问道。
“没有，车祸发生后两个月，医生终于答应可以会面，在警方去找伊东末彦的时候，却发现他早已逃之夭夭了。”
“那凶手就是他喽。”阿笠博士边开车边问。
“但是在那把枪的瞄准镜上发现了一种少见的睫毛膏，就是清水丽子使用的那款睫毛膏。”
“那她的自杀怕是假死的手段，她就是想要杀人灭口后还把罪名嫁祸给伊东末彦啊。”小说家用手撑着下巴思考。
“顺带一提，在伊东末彦出事后，他的公司被深山商事买下了。”
“这件事居然还和深山美术馆有关吗？就是基德偷走宝石的地方。”
“嗯，听说深山商事的董事长深山总一郎似乎和伊东末彦关系很好呢。而且抢劫运钞车的那天，似乎发生了枪战。”
“那么歹徒的脸可能被基德看见了。”
阿笠博士则在一旁插话：“毛利那边似乎也有线索，说是一位清洁工听到厕所里传来咔啷咔啷的声音后看见伊东末彦抱着高尔夫球袋从里面跑了出来。”
“那声音就是弹壳坠地的声音。”
“而高尔夫球袋里装着的就是狙击枪了。”
解开谜团的二人很是兴奋，柯南顺便问一下阿笠博士，毛利小五郎的情况。
“他说已经破案了，要先去找委托人报告啊。”
“等等，毛利侦探他该不会是......”小说家提醒了一下两人。
“糟了，要是叔叔他搞错了对象可就麻烦了！”