在春日部的一个阳光明媚的日子里，野原新之助像往常一样，哼着奇怪的小曲儿，一蹦一跳地从双叶幼稚园回到家。
“妈妈，我回来啦！”小新刚进门就大声喊道。美伢正在厨房准备晚餐，听到小新的声音，探出头来回应：“小新，今天在幼稚园过得怎么样？”小新把书包往地上一扔，跑到客厅沙发上一躺，说：“妈妈，今天风间带了一包米果到幼稚园，可好吃啦！”美伢从厨房走出来，一边擦手一边说：“是吗？那你有没有乖乖的，没抢别人的米果吃吧？”小新坐起来，一本正经地说：“我才没有抢呢，不过我发现了一个大秘密哦！”美伢好奇地问：“什么秘密？”小新神秘兮兮地凑近美伢，小声说：“我发现风间只吃米果里的花生，把其他的都剩下了。”
美伢听了，忍不住笑了起来，说：“哎呀，这算什么秘密呀，也许风间就是喜欢吃花生呢。”小新却不这么认为，他觉得这件事肯定没那么简单。于是，吃完晚餐后，小新拉着小白，嘴里念叨着：“小白，我们去调查花生的奥秘啦！”就出了门。
小新带着小白来到风间家楼下，他让小白在草丛里等着，自己则偷偷溜到风间家的窗户下。透过窗户，小新看到风间正坐在客厅的地板上，面前放着一堆零食，果然又在挑花生吃。小新心想：“风间为什么只喜欢吃花生呢？难道花生里有什么特别的东西？”
就在小新想得入神的时候，风间突然站起来，朝窗户这边走过来。小新吓了一跳，赶紧蹲下身子，躲在窗户下面。风间打开窗户，探出头来，左右看了看，然后又关上窗户，回到屋里去了。小新拍了拍胸口，自言自语道：“好险啊，差点就被发现了。”
小新觉得在风间家这里也查不出什么名堂，就带着小白去了阿呆家。阿呆是个喜欢收集石头的家伙，小新觉得他可能会知道一些关于花生的奇怪知识。阿呆正在院子里摆弄他的石头，看到小新和小白来了，笑着打招呼：“小新，你怎么来了？”小新开门见山地问：“阿呆，你知道花生有什么奥秘吗？”阿呆歪着头想了想，说：“花生嘛，就是一种可以吃的东西呀，还可以用来榨油。”小新听了，有点失望，说：“哎呀，我不是问这个啦，我是说花生有没有什么特别的、神奇的地方？”阿呆想了半天，还是摇摇头。
小新又带着小白去了妮妮家。妮妮正在家里玩她的超真实扮家家酒，看到小新来了，高兴地说：“小新，快来和我一起玩扮家家酒呀。”小新可没心思玩扮家家酒，他问妮妮：“妮妮，你知道花生有什么奥秘吗？”妮妮眨了眨眼睛，说：“花生的奥秘？是不是吃了花生就会变得像动感超人一样厉害？”小新听了，眼睛一亮，说：“有可能哦！那你有没有试过吃了花生之后变厉害呀？”妮妮摇摇头说：“我没试过呢。”
小新觉得还是没有找到答案，他带着小白继续往前走。走着走着，他们来到了春日部公园。公园里有一群大人正在举办一个野餐会，地上摆满了各种食物，其中就有一大盘花生。小新看到花生，立刻跑了过去，拿起一颗花生就问旁边的一位叔叔：“叔叔，你知道花生有什么奥秘吗？”叔叔被小新问得一愣，然后笑着说：“小朋友，花生的奥秘啊，那可多了去了。花生含有丰富的蛋白质和维生素，吃了对身体好呀。”小新听了，似懂非懂地点点头，说：“哦，原来是这样啊。”
就在小新准备离开的时候，突然听到有人喊：“抓小偷啊！”小新回头一看，只见一个穿着黑色衣服的人正拿着一盘花生拼命地跑，原来是有人偷了野餐会上的花生。小新想都没想，就大喊一声：“动感超人，出动！”然后追了上去。小白也跟着小新一起跑，一边跑还一边叫着，好像在给小新加油。
小新跑得还挺快，不一会儿就追上了小偷。他伸手抓住小偷的衣服，说：“你这个小偷，为什么要偷花生？”小偷没想到一个小孩子居然能追上他，有点慌张地说：“我……我不是小偷，我只是太喜欢吃花生了，看到这么多花生，忍不住就想拿一些。”小新皱着眉头说：“喜欢吃也不能偷呀，这是别人的东西。”小偷听了，不好意思地低下了头，把花生还给了野餐的人们。
野餐的人们都夸小新是个勇敢的好孩子，小新得意地笑了。不过，他还是没有忘记自己的任务，他问大家：“你们知道花生有什么奥秘吗？”大家听了，都笑了起来，你一言我一语地说开了。有的人说花生可以做成美味的花生酱，有的人说花生的壳可以用来做工艺品，还有的人说花生是一种很重要的农作物，能给农民伯伯带来很多收入。
小新听了大家的话，觉得收获还挺大的。他带着小白回到家，兴奋地把自己今天的经历告诉了美伢。美伢听了，笑着说：“小新，你还真是个爱探索的孩子呀。其实花生的奥秘还有很多呢，等你长大了，多看书，就会知道更多啦。”小新点点头，说：“嗯，我以后一定要好好学习，把花生的所有奥秘都弄清楚。”
这天晚上，小新做了一个梦，他梦见自己变成了一颗巨大的花生，在田野里快乐地生长着。周围还有很多小伙伴，他们一起唱歌、跳舞，开心极了。第二天早上，小新醒来，想起昨晚的梦，忍不住笑了起来。他又带着小白出门了，准备去幼稚园把自己发现的花生的奥秘告诉风间他们。
来到幼稚园，小新迫不及待地把小伙伴们都叫到一起，说：“我昨天发现了花生的好多奥秘哦！”然后，他就把自己昨天的经历和听到的关于花生的知识，一五一十地讲给大家听。小伙伴们都听得津津有味，风间听了，也不好意思地说：“其实我就是因为喜欢花生的味道，才只吃花生的。”大家听了，都哈哈大笑起来。
松阪老师看到孩子们这么开心，也走了过来，问：“你们在笑什么呀？”小新说：“老师，我们在讲花生的奥秘呢。”松阪老师听了，笑着说：“哦，原来是这样啊。其实花生确实有很多有趣的知识，比如花生是地上开花、地下结果的植物，这是不是很神奇呀？”孩子们听了，都惊讶地张大了嘴巴，纷纷说：“哇，原来花生还有这样的奥秘呀！”
就在这时，园长走了过来，说：“孩子们，今天我们来做一个关于花生的手工吧，用花生壳做一些漂亮的小工艺品。”孩子们听了，都兴奋地欢呼起来。于是，大家在园长的带领下，开始动手做花生壳工艺品。小新做了一个花生壳机器人，风间做了一个花生壳小船，阿呆做了一个花生壳石头城堡，妮妮做了一个花生壳娃娃，大家都做得很认真，也很开心。
做完手工后，孩子们把自己做的花生壳工艺品摆在桌子上，互相欣赏着。园长看着孩子们的作品，满意地点点头，说：“孩子们，你们做得都很棒！通过这次活动，你们不仅了解了花生的奥秘，还发挥了自己的想象力和创造力，真是太好了。”孩子们听了，都开心地笑了。
在这个充满欢乐和探索的过程中，小新和他的小伙伴们对花生有了更深的了解，也度过了一个非常有趣的一天。他们明白了，生活中的每一样东西都有它自己的奥秘，只要我们有一颗好奇的心，就能够发现很多有趣的事情。而花生，这个小小的食物，也因为他们的探索和发现，变得更加有趣和神秘了。