在宇宙边缘，藏着被灵蕴晶障庇佑的灵蕴秘界，与外界隔绝。这里充满灵蕴灵液，时而如璀璨银河，时而似静谧深海，拥有催生万物与回溯时光之力。空间如迷宫交错纵横，关键节点隐匿变幻；时间可凝缩、延展、跳跃交错 ，藏着无数秘密与危机。
一支宇宙边缘探索的科研舰队率先发现异样。飞船靠近灵蕴秘界时，灵蕴灵液探测器报警，原来是灵蕴晶障波动，释放灵蕴灵潮。灵潮环形扩散，过度浸润物质，导致原子重组，引发物质变异。这使得星球表面物质异常生长消退，生态濒临崩溃，星际能量传输紊乱，文明陷入生存危机。
蓝星宇宙灵蕴能量研究院捕捉到异常，判断是重大危机。九儿和青年凭借经验、对灵蕴能量的理解和敏锐洞察力，受命调查。青年盯着监测屏幕，兴奋又紧张：“妈妈，这次异动或许能改变我们对宇宙基础秩序的认知，是机遇也是挑战。”九儿面色凝重，点头道：“这股力量影响极大，宇宙基础秩序危急，我们要全力以赴。”
蓝星科研团队改装灵蕴探索者号飞船，配备灵蕴灵液适配引擎和超维导航系统。靠近灵蕴秘界时，空间被神秘力量重塑，光线折射，仪器报警。青年操控飞船，用频谱分析仪监测灵潮。
他们突破障碍进入核心区域，看到一座在灵蕴灵液海洋中的灵蕴灵殿。灵殿由神秘灵晶建造，符文闪烁，周围灵蕴灵环旋转，释放紊乱波动。灵殿发出精神波动：“我承载宇宙创造与修复法则，现被深渊灵墟的灵蕴掠夺者觊觎，他们想打破平衡，带来荒芜破败。”九儿回应会阻止邪恶，询问如何帮忙。
灵殿表示需集齐星辰灵蕴之杖、命运灵蕴残页和灵蕴平衡宝玉。星辰灵蕴之杖能净化灵蕴灵液、唤醒守护意志；命运灵蕴残页可助找到命运关键节点；灵蕴平衡宝玉掌控平衡法则，是恢复基础秩序的关键。
九儿和青年立刻出发。在星蕴幻域，他们被强大灵蕴之力笼罩，一番搜寻后在星辰碎片祭台找到星辰灵蕴之杖，多次尝试用共振装置解除护盾拿到。
命运灵蕴残页在命运灵蕴迷谷，这里命运灵蕴脉络交织，遍布吞噬一切的漩涡。他们多次遇险，最终在最深处找到残页。
灵蕴平衡宝玉在灵蕴失衡炼狱，这里灵蕴灵液失衡引发风暴。他们与守护者沟通后，用调和装置多次调整能量，修复故障仪器，恢复平衡，拿到宝玉。
带着三件圣物回到灵蕴灵殿，灵殿吸收后力量觉醒。灵蕴掠夺者派出灵蕴暗影生物抢夺，这些生物有的像黑色灵蕴晶体，能瞬间灵蕴化物体，有的像暗影火焰，污染灵蕴灵液。
九儿和青年与灵蕴灵殿并肩战斗。青年操控飞船用脉冲炮攻击，灵蕴暗影生物借混乱空间和紊乱灵能躲避。青年分析其规律调整策略。九儿持星辰灵蕴之杖念咒，释放净化之光，观察战场找弱点。灵蕴灵殿释放护盾并发射震荡波，与敌人碰撞引发爆炸。
战斗白热化时，青年发现灵蕴暗影统领，驾驶飞船发射导弹，被其灵蕴混沌屏障挡住。九儿借助灵殿之力，用星辰灵蕴之杖发出净化光柱打破屏障。青年抓住机会，发射毁灭光束，贯穿统领核心将其消灭。
其他灵蕴暗影生物大乱，九儿和青年乘胜追击，成功守护灵蕴灵殿。灵殿称赞他们拯救了宇宙基础秩序，鼓励继续探索。