联盟舰队朝着射线发射的方向迅速前进，他们在途中发射出各种能量护盾和干扰装置，试图削弱射线的能量。同时，林羽带领着精锐小队在射线发射装置内寻找关闭装置的方法。
装置内的各种仪表盘和能量管道因为射线的启动而疯狂闪烁和震颤，仿佛在嘲笑着精锐小队的无力。林羽集中精神，尝试用神器感知装置的能量核心和控制机制。神器发出的光芒在黑暗中不断穿梭，指引着林羽在错综复杂的线路和设备间寻找线索。
精锐小队的成员们也没有闲着，机械文明战士用他们的专业知识分析装置的能量回路，试图找到切断能量供应的节点；冰雪星球成员将冰冻能量覆盖在一些关键部位，延缓装置的运转；气态巨行星成员则与宇宙能量网络沟通，寻找能制衡这股黑暗射线的宇宙能量频率。
在战舰上，联盟舰队已经接近了射线。战舰的护盾在射线的冲击下剧烈颤抖，仿佛下一秒就会破碎。但舰队没有丝毫退缩，他们不断调整护盾的角度和能量输出，让护盾尽可能地承受和分散射线的能量。同时，战舰上的干扰装置全力工作，发出一波又一波的干扰波，与射线的能量相互碰撞，在宇宙中形成了绚烂而又危险的能量风暴。
在射线发射装置内，林羽终于找到了一丝头绪。他发现了一个隐藏在装置深处的神秘水晶，水晶中流淌着的能量与射线息息相关。林羽意识到，这可能就是控制射线的关键。他毫不犹豫地将神器的力量注入水晶，试图改变水晶的能量状态。
然而，神秘水晶似乎有着自我保护机制，它释放出一股强大的反冲能量，将林羽震飞出去。但林羽没有放弃，他再次站起，调整呼吸，与神器更加深入地融合。神器感受到了林羽的决心，光芒愈发耀眼，这次林羽带着更强大的力量冲向水晶。
在联盟舰队的努力下，射线的能量开始有了些许减弱的迹象。这给了林羽和精锐小队更多的时间。林羽再次接近水晶，他巧妙地避开水晶的反击能量，将神器的力量如涓涓细流般注入水晶的薄弱点。水晶开始出现裂痕，周围的能量也变得紊乱起来。
精锐小队的其他成员也纷纷前来支援，他们将各自的力量汇聚到林羽身上。机械文明战士的能量增强了林羽对神器的操控精度，冰雪星球成员的冰冻能量减缓了水晶的能量恢复速度，气态巨行星成员引导的宇宙能量为林羽提供了更强大的护盾。
在众人的齐心协力下，神秘水晶终于承受不住压力，彻底破碎。随着水晶的破碎，射线发射装置也开始出现故障，那道巨大的黑色射线逐渐消失，宇宙中的能量风暴也慢慢平息。
联盟舰队和精锐小队都松了一口气，但他们知道，战斗还没有结束。这个星系可能还有其他的危险，而且神秘组织的残余势力也需要彻底清除。林羽带领着精锐小队离开了射线发射装置，与联盟舰队会合。
他们开始对星系进行全面的搜索和清理。在搜索过程中，他们发现了神秘组织的一些秘密基地和隐藏的武器库。这些地方都被设置了各种机关和陷阱，但对于经历了重重考验的联盟来说，都不再是无法克服的困难。
经过数天的努力，联盟成功地清除了神秘组织在这个星系的所有痕迹，解除了宇宙危机的最后威胁。他们带着胜利的喜悦和疲惫，踏上了返回联盟总部的路程。这次胜利将成为宇宙历史上的一个重要里程碑，而联盟也将继续守护宇宙的和平，成为宇宙中永恒的希望之光。