特别调查部队、“曙光守护者”与神秘舰队紧密合作，争分夺秒地筹备对抗神秘势力与极端组织的行动。根据神秘舰队提供的情报，他们锁定了神秘势力可能藏匿的一处隐秘基地，同时也摸清了极端组织发动袭击的具体时间和路线。
联盟各方迅速行动，调配最精锐的力量。特别调查部队与神秘舰队的科研人员一起，利用神秘舰队带来的技术，成功解析出超级文明遗迹中隐藏的关键信息，找到了彻底封印危险技术的方法。他们计划在极端组织发动袭击前，先捣毁神秘势力的基地，切断其对极端组织的支持，然后再全力阻止袭击。
行动当天，宇宙舰队兵分两路。“曙光守护者”带领联盟执法部队和部分舰队，在科研基地周围设下天罗地网，等待极端组织的到来。而特别调查部队则与神秘舰队一同，悄然驶向神秘势力的隐秘基地。
当接近基地时，他们遭遇了强大的防御火力。神秘势力的基地配备了先进的能量武器和护盾系统，一时间，双方的能量光束在宇宙中交织，战斗异常激烈。特别调查部队和神秘舰队凭借着精湛的战术和默契的配合，逐步突破防御。
与此同时，在科研基地方向，极端组织的舰队如期而至。“曙光守护者”一声令下，防御系统全面启动，双方展开了一场惊心动魄的太空大战。联盟舰队利用地形和先进的武器系统，顽强抵抗极端组织的进攻。
在神秘势力基地，特别调查部队终于突破重重防御，进入内部。他们发现神秘势力正在启动一项危险的装置，企图解开超级文明封印的危险技术。特别调查部队的队员们不顾危险，与神秘势力展开近身搏斗，成功阻止了装置的启动，并将其摧毁。
随着神秘势力基地被摧毁，极端组织失去了背后的支持，士气大减。“曙光守护者”抓住机会，发动全面反攻，一举击溃了极端组织的舰队。
危机终于解除，宇宙迎来了新生。特别调查部队、“曙光守护者”与神秘舰队成为了全宇宙的英雄。在这场浩劫过后，宇宙各文明之间的联系更加紧密，他们共同致力于研究超级文明的遗产，以和平、科学的方式探索宇宙的奥秘，防止类似的危机再次发生。宇宙在经历这场洗礼后，步入了一个更加繁荣、和谐的新时代。
在成功化解神秘势力与极端组织带来的危机后，宇宙迎来了一段短暂的和平繁荣期。各星系间的交流合作愈发频繁，科技发展日新月异，宇宙文明在共同努力下迈向新的高度。然而，特别调查部队和“曙光守护者”并未因此放松警惕，他们深知，危机虽已暂时平息，但一些潜在的隐忧依然存在。
对超级文明遗迹的研究仍在持续深入，虽然成功阻止了危险技术的解封，但科研人员发现，超级文明所遗留的科技体系极为庞大复杂，其中仍有许多未知领域等待探索。这些未知科技一旦被不当利用，随时可能引发新的危机。而且，在对遗迹资料的进一步解读中，发现了一些暗示存在其他隐藏势力的线索，这些势力或许也在暗中觊觎超级文明的遗产。
与此同时，极端组织虽遭受重创，但并未被完全消灭。一些残余势力分散在宇宙的阴暗角落，他们潜藏起来，伺机卷土重来。这些残余势力不断煽动不满情绪，蛊惑一些意志不坚定的人加入他们，逐渐形成一股暗流，威胁着宇宙的和平稳定。
为了应对这些潜在威胁，特别调查部队和“曙光守护者”决定扩大对超级文明遗迹的探索范围。他们组建了多支探索小队，分别前往宇宙中其他可能存在超级文明遗迹的区域。这些小队由经验丰富的战士、科研人员和技术专家组成，配备了最先进的探测和防御设备。
在一次探索任务中，一支小队在一个偏远星系发现了一座隐藏在时空褶皱中的神秘建筑。这座建筑散发着奇异的光芒，其结构和材质与已知的超级文明遗迹有相似之处，但又存在明显差异。当小队试图靠近时，建筑周围突然出现了一些能量体生物，它们对小队发起攻击，其攻击方式和能量特征同样充满神秘色彩。
特别调查部队和“曙光守护者”能否在这座神秘建筑中揭开更多关于超级文明的秘密，同时应对可能出现的新威胁？他们又将如何彻底清除极端组织的残余势力，确保宇宙的长治久安？在这看似平静却暗流涌动的后危机时代，他们再次踏上充满挑战的征程。