在四川凉山州西昌城外 80 千米处普格山的地下， 鳄鱼控制的空间器生产基地被鳄鱼基地主管牢牢地控制着， 这是鳄鱼控制的一个分部生产基地。 整个基地被一个封闭的外壳罩着， 里面是生产中心， 一个人就有一条鳄鱼监控着。 面对鳄鱼的力量， 人类不是它们的对手， 只有被奴役， 为它们劳动。
香港海域水下鳄鱼控制的航空器生产基地总设计师伍安， 被带到了鳄鱼主管的办公室。 鳄鱼主管面对原材料不足， 要求伍安利用地下的资源， 在基地就地解决， 不能放一个人出去， 以免被发现。 伍安认为这是最好的逃跑机会， 便说这不可能， 即使能解决， 也没有将地下的各种物质进行转化的设备。 要制造设备， 基地的生产工具和原料是不行的， 必须从外部运来。 鳄鱼主管强行要求伍安解决， 如果不解决就杀人，每一天杀一个， 直到杀死每一个人。
疯狂的鳄鱼主管杀害了一个又一个人， 有伍安的好朋友、 同事、 妻子和弟妹， 伍安承受着巨大的精神压力， 多次差一点就没有坚持住。 但在被杀害的朋友、 同事和亲人的鼓励下， 伍安忍着悲痛， 坚持自己的观点。 鳄鱼主管见没有效果， 也没有更好的办法。 它向鳄鱼王汇报后， 同意伍安出来到地面工作， 但是仍在严密的监控下。
伍安在鳄鱼的押解下进入了通往凉山的地下通道。 这是鳄鱼经过几十年工作挖的通往凉山的密道， 工程宏大。 伍安到达凉山后， 从普格山顶上的一个密道里上了地面， 见到了久违的虽然已暗淡的阳光和山下的人们。 鳄鱼对伍安严密看管， 与山下的人们离得很远， 都是在凉山深山无人的森林和山川、 草原里寻找原材料。 伍安故意拖延着， 要寻找机会逃出去。
终于， 在深山的一个地方， 伍安发现有一个森林探险旅游中心。 伍安故意向探险屋靠近， 但被鳄鱼小分队拦住了。 伍安说， 临近探险屋有原材料， 需要做取样分析。
鳄鱼小分队要消灭屋里的人。 伍安见可能要坏事， 停止了靠近。
屋里的人乘粒子车要出去。 粒子车的声音引起了伍安的注意。 伍安说要上卫生间， 趁鳄鱼不注意， 终于跑了出来， 直接向探险屋前的停车场跑去， 大叫着： “ 香港！ 鳄鱼！”
后面鳄鱼更快地追了过来， 要抓住伍安。 粒子车上的人被眼前的一幕惊呆了， 看到几只鳄鱼在抓一个人， 反应过来后异口同声惊呼： “ 鳄鱼！”
粒子车上的人拿出防卫枪， 对准鳄鱼就是一阵扫射。 同时， 接通 110 声讯系统， 向凉山警务中心报了案。 粒子车上的人向鳄鱼扫射， 为伍安争得了一点宝贵时间。 伍安快要跑到粒子车下时， 鳄鱼小分队赶到， 围住了粒子车。 车上人向伍安扔出了绳梯， 鳄鱼小分队一阵扫射， 打中了伍安， 粒子车也中了弹。
危急中， 必须立即起飞， 否则车毁人亡。 粒子车飞了起来， 摇摇摆摆地离开了地面。 车上人将伍安拉上了粒子车， 快速上升， 离开地面。
车上人抱住伍安， 给伍安止血。 伍安挣扎着说： “ 香港———下面———鳄鱼———”话没说完就咽了气。
粒子车将伍安送到了西昌市中心医院， 西昌市市长和警务中心警察赶到了。
车上人员立即被警务人员控制， 带到警察局接受调查， 他们述说了这一切经过。
信息立即报到了北京， 维安厅立即召开紧急会议， 同时向西安最高委员会报告， 向行政部、 军事部做了通报。 这是自鳄鱼在世界各地袭击人的事件有所平息后，
发生的第一起严重侵犯人类的鳄鱼事件。
“ 香港———下面———鳄鱼———” 这一情报， 引起了专家们的重视。 维安厅请军事部协助， 由军事部派海洋战斗支队深入香港水域调查， 要弄清楚两年前的地震与这个事件的关联。
一总队接受了这次任务， 命令 401 战斗大队执行。 401 战斗大队到了香港水下， 与鳄鱼正好相遇， 展开了激战。 原来， 鳄鱼得到报告， 知道事情败露了， 正在转移基地。
401 战斗队返回地面， 向越浩做了报告。 最高委员会得到报告后， 立即召开专家会议， 研究对策。 几年来发生的一系列鳄鱼事件的真相终于大白于天下。 鳄鱼变异了， 变得有智慧和行动更灵了。 生命科学委员会将鳄鱼重新命名为 “ 智鳄”。
智鳄明白事情已败露， 号召全世界鳄鱼向人类发起全面进攻。
智鳄要控制人类， 人类不得不反抗。 面对智鳄的进攻， 人类进入了全面紧急状态， 世界各地都与智鳄进行着战斗。
行政部发布了智鳄入侵人类风险警报， cctv 等媒体进行着深度跟踪报道。