胜利的欢呼声最终会平息，取而代之的是紧张而忙碌的战后清理和重建工作。
这场防御战虽然最终以反抗方的奇迹般胜利告终，但也付出了不小的代价。避难所外围的防御工事几乎被完全摧毁，不少反抗者在战斗中牺牲或重伤，储存的武器弹药和能量也消耗巨大。
但所有人的脸上，都洋溢着一种难以言喻的振奋和希望。他们击退了主脑最精锐的“第一执行序列”，守住了自己的家园！这场胜利，对于长期在黑暗中挣扎的反抗者们来说，意义非凡，它极大地鼓舞了士气，也证明了主脑并非不可战胜！
而陈舟，这位在战斗中两次力挽狂澜、展现出不可思议力量的外来者，无疑成为了整个避难所最受尊敬和感激的人。
他再次因为透支而陷入了休养状态。不过这一次，有了之前的经验，再加上“森林之心”天赋的强大恢复力，以及据点提供的最好资源（包括一些从机器人残骸中回收的、品质不错的能量块），他的恢复速度比上次快了不少。
在他休养期间，整个避难所都在高效地运转着。
银面、铁锤和终端等人，一方面组织人手修复防御工事、救治伤员、清点损失；另一方面则加紧分析从战场上回收的机器人残骸，希望能从中获取更多关于主脑技术和弱点的情报。
零则成为了陈舟的“专职护工”，几乎寸步不离地守在他身边。或许是因为共同经历了生死，或许是因为陈舟向他展现了道标的秘密，少年对陈舟的态度发生了明显的变化，不再是最初的警惕和试探，而是充满了全然的信任和依赖。他会主动和陈舟分享一些关于“失落序列”的秘密，以及他从父母那里听来的、关于星海的零星传说。
莉莉也经常会跑来看望陈舟，叽叽喳喳地向他讲述据点里的各种趣事，或者好奇地追问关于森林世界和地球的故事。她的活泼开朗，为这个压抑的地下世界带来了一抹亮色。
通过这些交流，陈舟对“暗影”组织和这个地下世界的了解也越来越深。他发现，这个组织虽然松散，但内部却有着一种独特的凝聚力。他们或许背景各异，能力不同，甚至彼此间也存在矛盾，但在反抗主脑、追求自由这个共同的目标下，却能爆发出惊人的能量。
他也更加清晰地认识到主脑的可怕。根据终端的分析，这次“清理”行动虽然失败，但主脑很可能已经通过撤退的机器人（虽然最后两台被陈舟砸毁，但之前的战斗数据可能已经上传）获取了关于避难所防御能力、陈舟特殊力量以及星图烙印异常激活等关键情报。
下一次，主脑的攻击只会更加猛烈、更加精准、更加不计代价！
平静只是暂时的，更大的风暴随时可能再次降临。
大约五天后，陈舟的身体基本恢复，道标的能量也重新充盈起来。
这一天，银面、铁锤、终端以及零，一起来到了陈舟的住处。
银面的表情异常郑重。她看着陈舟，开门见山地说道：“陈舟，经过这次战斗，我们都看到了你的力量和决心。我代表暗影第三分队，再次……也是最后一次，正式邀请你加入我们。”
她顿了顿，语气变得更加诚恳：“我们知道，你来自另一个世界，有你自己的目标和追求。我们不会强迫你永远留在这里，也不会束缚你的自由。我们只希望，在你停留在这个世界的这段时间里，能够与我们并肩作战，共同对抗主脑这个共同的敌人。”
“作为回报，‘暗影’将向你开放所有的情报资源，提供力所能及的物资和技术支持，帮助你了解这个世界，寻找你想要的线索。甚至……如果你愿意，我们可以共享关于‘失落序列’和一些先驱者遗迹的研究成果。”
“而且……” 银面看了一眼零，“‘幽灵’的星图烙印，或许隐藏着离开这个世界的关键。与我们合作，或许也是帮助你自己。”
铁锤瓮声瓮气地说道：“陈舟兄弟，你是个爷们！俺铁锤服你！跟我们一起干吧！”
终端也难得地开口，声音依旧有些失真，但带着一丝认同：“你的能力……很特殊，对于分析主脑的符文体系和寻找它的漏洞，或许能提供全新的思路。”
零则没有说话，只是用那双明亮的眼睛看着陈舟，眼中充满了期盼。
陈舟看着眼前这几位在战斗中结下深厚情谊的伙伴，感受着他们言语中的真诚和期盼，心中早已有了答案。
经过这段时间的相处和并肩作战，他早已将自己视为这个集体的一份子。无论是为了守护这些值得尊敬的朋友，还是为了对抗那个冰冷的、试图抹杀一切自由意志的主脑，亦或是为了探索这个世界更深层次的秘密和寻找回归之路，与“暗影”合作，都是目前最好的选择。
他站起身，脸上露出了认真的表情，伸出手，依次与银面、铁锤、终端和零紧紧相握。
“我加入。”
简单的两个字，却重若千钧。
它代表着一份承诺，一份责任，也代表着……一份全新的开始。
看到陈舟答应，银面等人脸上都露出了发自内心的笑容。压抑已久的避难所里，似乎也因为这个决定，而增添了一份更加明亮的希望之火。
银面从怀中取出一枚由特殊合金打造、刻着一个抽象的、仿佛在阴影中燃烧的火焰图案的徽章，郑重地递给陈舟。
“欢迎加入‘暗影’，陈舟。” 她说道，“从今天起，你就是我们中的一员。这枚‘暗影徽章’，是身份的证明，也内置了加密通讯和基础权限识别功能。”
陈舟接过徽章，入手微凉，能感觉到其中蕴含着微弱的能量波动和复杂的符文结构。他将其佩戴在胸前。
“好了，既然大家都是自己人了，” 铁锤大大咧咧地说道，“队长，我们接下来该怎么办？主脑肯定不会善罢甘休！”
银面脸上的笑容收敛，恢复了冷静和干练：“没错。主脑的报复随时可能到来。我们必须尽快完成转移，将大部分非战斗人员和物资送到更安全的古老遗迹。”
“同时，” 她看向陈舟，“我们需要尽快提升实力，特别是针对主脑的弱点进行研究。陈舟，你的特殊能量和道……伙伴的解析能力，将是我们的关键。”
她又看向零：“‘幽灵’，你的星图烙印被激活，虽然带来了希望，但也可能引来主脑更疯狂的觊觎。我们需要尽快研究清楚它的作用和风险。”
“所以，” 银面深吸一口气，眼中闪烁着坚定的光芒，“我们的任务很重，时间也很紧迫。”
“修复防御，安全转移，解析科技，激活星图……”
“反击的号角，或许还很遥远，但至少，我们要在这片阴影之下，牢牢地守住这片……属于我们的火种！”
陈舟、零、铁锤、终端，四人齐齐点头，眼中同样燃烧着名为希望和决心的火焰。
一场围绕着科技、神秘、反抗与生存的暗影之战，伴随着一个外来者的正式加入，以及一枚星图烙印的微光，在这座冰冷的钢铁都市的地下深处，悄然拉开了新的序幕。