联合舰队跨越无数星域，终于抵达星轨罗盘标记的“火种之源”——这片区域没有恒星，只有一座悬浮在宇宙中的巨型“起源圣殿”。圣殿由淡金色的晶体构建，表面刻着宇宙中所有已知文明的纹路，从紫晶文明到星晶文明，从守望者文明到人类联盟，仿佛是一座记录宇宙文明史的纪念碑。
“探测器检测到圣殿中心有‘终极火种’的能量反应，它的能量强度是之前所有火种的百倍！”操控员的声音带着激动，“但圣殿外围有一层‘起源屏障’，屏障的能量频率与所有唤醒的火种完全一致，需要将时空晶核、幻惑晶核、文明火种等所有火种同时嵌入屏障的凹槽，才能打开通道！”
云航看着屏幕上屏障的凹槽分布图，正好对应着他们唤醒的六颗文明火种。“立刻将所有火种分别安置在六台机甲上，由我带领小队进入圣殿外围，嵌入凹槽！”他下令，“‘星尘号’、晶枢星舰与星晶战舰组成防御圈，防止未知威胁突袭——这里是火种之源，绝不能出任何差错！”
六台搭载火种的机甲跟随“陨星”驶向起源圣殿，当他们靠近屏障时，屏障表面的凹槽自动亮起，与机甲携带的火种产生强烈共鸣。云航操控“陨星”将反畸变核心嵌入最中央的凹槽，随后，时空晶核、幻惑晶核等火种依次被嵌入周围的凹槽。
当最后一颗火种嵌入时，起源屏障发出耀眼的金色光芒，缓缓向两侧打开，露出通往圣殿内部的通道。通道两侧，矗立着无数由晶体雕刻而成的“文明守护者”雕像，它们的姿态各异，却都朝着圣殿中心的方向，仿佛在守护着终极火种的秘密。
机甲小队沿着通道前行，很快抵达圣殿中心的“起源大厅”。大厅中央，一颗篮球大小的“终极火种”悬浮在半空中，它的表面流转着宇宙中所有已知能量的颜色，从银核的蓝色到星枢的金色，从星核的暖光到共生晶核的紫色，仿佛蕴含着宇宙的本源能量。
“这就是终极火种！它能为所有文明提供源源不断的守护能量，还能预测宇宙中所有潜在的危机！”星晶首领的声音通过通讯器传来，语气中满是敬畏，“星轨罗盘显示，只要将终极火种的能量注入星核之心，就能在宇宙中建立‘跨星域守护网’，彻底杜绝暗渊、暗域这类危机的爆发！”
云航正准备靠近终极火种，起源大厅的地面突然剧烈震动，通道两侧的文明守护者雕像竟缓缓苏醒——它们的眼中亮起红色光芒，躯体表面覆盖上暗紫色的能量，显然是被某种未知力量操控，成为了终极火种的“终极守卫。”
“是‘混沌能量’！它在污染守护者！”晶枢战士的声音带着震惊，“这种能量比暗渊能量更古老，能侵蚀所有文明的防御，是宇宙诞生之初就存在的负面能量！”
第一具守护者雕像率先发起攻击，它挥动晶体巨斧，朝着“陨星”劈来。云航操控机甲侧身躲开，巨斧落在地面上，将大厅的晶体地板劈出一道深沟。可更多的守护者苏醒过来，它们有的释放能量束，有的挥舞武器，将机甲小队包围在大厅中央。
“保护终极火种！绝不能让混沌能量污染它！”云航的指令刚落，一台搭载幻惑晶核的机甲就被守护者击中，晶核从机甲上脱落，朝着地面摔去。云航立刻驾驶“陨星”冲过去，在晶核落地前将其接住，可背后却被另一具守护者的能量束击中，机甲的护罩当场破裂，装甲出现大面积裂痕。
“将所有火种的能量注入终极火种！它能释放净化能量，驱散混沌能量！”星轨罗盘突然在“陨星”的主控屏幕上亮起，传来一道古老的意识——正是建造起源圣殿的“创世文明”留下的信息，“只有融合所有文明的力量，才能彻底封印混沌能量！”
云航立刻下令：“所有机甲将火种能量传输给终极火种！”六台机甲同时释放能量，淡金色、淡蓝色、淡紫色的能量流汇聚到终极火种上。终极火种的光芒瞬间暴涨，一道巨型净化能量波以大厅为中心扩散，所到之处，守护者雕像上的混沌能量快速消融，红色的眼睛重新恢复成清澈的金色。
当最后一丝混沌能量被净化，起源圣殿的地面停止震动，文明守护者雕像重新恢复成静止状态。终极火种的光芒逐渐稳定，释放出一道温和的能量流，注入“陨星”机甲携带的星核之心。星核之心的光芒变得更加璀璨，开始与联合舰队的所有星舰建立能量连接。
“跨星域守护网已启动！”“星尘号”的操控员兴奋地喊道，“宇宙中所有已知星域都已覆盖守护能量，暗渊、暗域的残留能量正在被快速净化！”
云航看着悬浮在半空中的终极火种，又看向通讯器里各文明欢呼的画面，知道这场跨越无数生死的守护之战，终于迎来了圆满的结局。起源圣殿的通道缓缓打开，联合舰队的星舰驶入大厅，所有文明的代表聚集在终极火种周围，共同见证这一历史性的时刻。