自来也回到木叶之后，没有先去找猿飞日斩，而是先和猪鹿蝶三族族长见面。
“最近村子发生什么事了，宇智波一族和志村一族火拼的原因是什么？”自来也先和他们了解情况。
奈良鹿久仔细的和自来也解释道：“最开始是有疑似根部忍者到各大家族族族地掳掠孩子，宇智波神秀带队抓捕。追到死亡森林里根部据点，那里已经被宇智波一族攻下来了，被掳掠的孩子都在那里。然后宇智波神秀带着人攻打下来旁边的根部实验室，里面有很多见不得人的研究，还有二十多双写轮眼。然后宇智波一族就和志村一族火并了。”
听了鹿久的解释，自来也的脸色愈发凝重。他手指无意识地摩挲着下巴，眼神中闪过一丝难以置信。“二十多双写轮眼......团藏他竟然敢做这种事？难怪宇智波要报复。”自来也气愤的说道。奈良鹿久叹了口气：“具体情况我们也不甚清楚，毕竟我们到的时候已经结束了战斗。宇智波一族得战斗力真了不得，几十人就几乎把志村一族所有忍者全都消灭。”
自来也皱着眉头沉思，此时局势比他想象中还要复杂，心中对团藏也升起了怨念。奈良鹿久见自来也这表情，安慰道：“自来也大人，您也不必过多担心。事情是团藏惹出来的，主要也是要火影大人处理，我估击火影大人召您回来，只是对高端战力的补充，以防万一。”
自来也点点都说道：“我先去实验室那里看看。”说完便赶往根部实验室。到了实验室外面，这里已经被暗部忍者管控起来，自来也先是到达埋尸体的地方，这里有忍者正在挖掘。自来也看着那些两个头的，好几个手的，还有半人半傀儡的，半人半兽的尸体目光充满愤怒。在他仔细查看尸体的时候，突然看到几具尸体有点眼熟。他走到尸体跟前，将尸体翻开，认出尸体身份后一股怒火从心底升起，身上查克拉不自觉的狂暴起来。这里有两个是他以前的部下，虽然不是亲信，但也是一起做过任务的。自来也死死盯着那两具扭曲变形的尸体，指节因用力而泛白。他想起当年这两个部下执行侦查任务时失踪，当时暗部给出的报告是“失踪”，如今看来竟是被团藏当成了实验品！
“什么人，竟然敢擅闯禁地！”一队暗部站在自来也身后，握着武器，警惕的看着这个白发男人。
自来也转身，周身的杀气如实质般弥漫开来。暗部成员只觉一股寒意从脚底直冲天灵盖，握着武器的手不由自主地颤抖起来。“滚。”自来也的声音低沉沙哑，带着不容置疑的威严。暗部成员对视一眼，虽心有不甘，却不敢违抗这位传说中的三忍之一，只能咬牙退到一旁。自来也不再理会他们，径直走进实验室内部。实验室虽然被清理过，但是残留的痕迹还是能告诉世人这里试验的残忍。
自来也一直板着脸，周身气息冷的可怕。他走出实验室，抓着一个暗部问：“说，这里有多少尸体。”被问的暗部人员被此时的自来也吓住，只得说道：“自来也大人，这里大约有八百多具尸体，其中最早的一批都是二十年以前的。”
“该死！”自来也将暗部推开，往火影大楼走去。
猿飞日斩正在办公室处理文件，由于被自来也夺权了，现在送到他手上的只有一些鸡毛蒜皮的小事。比如公园需要修建一座公共厕所，猿飞日斩将之驳回，并且做了批示：需要统计每天有多少人去这个公园，这段路每天有多少多少人经过。以及需要货比十家，选出最合适的施工单位。批示完后，猿飞日斩伸了一个懒腰，喃喃自语道：“即使是一些小事，也要认真处理，这就是我的忍道。”
窗外出现一个白发男子，猿飞日斩瞥了一眼，见是自来也，便继续批阅手上的文件。这一份是木叶孤儿院提交的，由于战争影响，木叶战争孤儿多了很多。孤儿院院长申请一批经费用于修缮孤儿院以及生活费。猿飞日斩直接打回。他有一位子侄做生意亏了不少钱，这段时间天天求他。他也不忍心见侄子亏钱，于是大笔一挥将福利预算全都划到自己家族账上。心里想着：我这也是为了木叶经济复苏做贡献，苦一苦那些小鬼，骂名我来担，这全都是火之意志啊。
自来也面沉如水，看着如此贪恋权力的老师，心里百感交集。等待猿飞日斩批阅几份文件，停下来之后，自来也说道：“老头子，我回来了。这次你们做的太过分了。”
猿飞日斩深吸一口烟斗，熟悉的说道：“人体试验最开始是二代火影大人发起的。我担任火影之后这个一直是团藏在做。我对他要求是只能用自愿的忍者，而且要保证志愿者的安全。我也没想到他对我也有欺骗。我也有错，疏于管理，竟然让他酿成如此大错。”
面对猿飞日斩日常甩锅，自来也不为所动。以往十几年，每次有不好的事情，猿飞日斩都会推到团藏身上。自来也盯着猿飞日斩问道：“我今天去实验室看了，那些尸体里有我以前几个部下。当时任务班给的情报是失踪，可是他们却成了试验品。猿飞老师你知道这件事吗？”
猿飞日斩脸上一闪而逝的露出一丝慌乱，他拿起茶杯喝了一口茶，慢慢的说道：“我不知道，应该是团藏做的，你知道的，这种小事到不了我这里。”
自来也已经看出猿飞日斩是在说谎，眼底透露出深深的失望，他继续问道：“那团藏怎么处理？”
“你觉得怎么处理合适？”猿飞日斩没有直接回答，反而问自来也的意见。
“当然是审判，然后处死，由宇智波来行刑。”就团藏做的事，死上十次都不过分。自来也自然不想包庇团藏，处死团藏可以稳定村子的局势，也可以借此拉拢宇智波。
“唉”猿飞日斩长叹一口气，连自来也都是这个态度，看来这次没有这么好过，他调整克一下情绪，悲伤的说：“自来也啊，我现在也老了，也没几年好活了。我也不想再生命最后几年，身边没有几个老友。我已经解除了团藏所有职务，并把他关起来了。看在他以往的功绩，就留他一条命把。”
自来也还是不想放过团藏，说道：“团藏这件事做的太过分了，如果不处死。各大家族怎么交代，宇智波那边怎么交代？”
猿飞日斩说道：“没你想的那么麻烦，其他家族的孩子，这不是还没遇难吗？宇智波一族不都快把志村一族忍者都杀光了吗？你去问问看他们要什么，都能谈的嘛。我最近身体也不好了，木叶的未来就要看你和水门了。大蛇丸和团藏暗中有勾结，背离了火之意志，汝当勉励之啊。”
自来也虽然不想放过团藏，但是若是能给水门铺路，那先留着团藏也是可以的。于是就松了口：“这次团藏的事情我就不管了，宇智波那边我也会去问问。走了，老头子，看好团藏，”
自来也转身，正欲离开火影大楼，脚步却又一顿。他回过头，目光如炬地盯着猿飞日斩，语气中带着几分警告：“老头子，我告诉你，要是团藏再搞出什么幺蛾子，或者你有什么包庇他的举动，到时候可别怪我不念师生情分。木叶的安稳，容不得半点马虎。”
猿飞日斩微微点头，脸上露出一丝疲惫的笑容：“知道了，你放心去吧，我会处理好的。”