有人拍案反对：为什么要冒险去研发可能不被广泛适用的专用芯片？这不符合规模经济效应，而且失败的可能性很高。一位资深工程师在技术论证会上直言不讳。
有人顶力支持:通用架构的效率瓶颈已经显现，唯有革命性的专用设计，才能实现“方舟”计划追求的百倍千倍效能提升，这是“换道超车”的关键。
最后的主要障碍则来源于部门协同的“藩篱”。
如此庞大的项目，涉及发改委、科技部、工信部、中科院、军方以及地方等多个实体。
各部门虽有合作意愿，但固有的职责划分、审批流程和利益考量，形成了无形的“藩篱”。
协调会议开了无数次。
文件在各个部门间流转。
会签的进程缓慢。
到底由哪个部门主导？
资金究竟如何分担？
建成后的管理运维权属归谁？
这些问题看似微小和琐碎，却足以让一个宏大计划陷入停滞。
所以很多事情都是说起来简单，做起来则是千难万难。
但危机中同样孕育新机。
一场由决策层主持的小范围、高规格的专项汇报会提前开启了。
陆时羡受邀进行再次论证。
但这一次，他面对的听众更少，但决策权更重。
陆时羡还没来得及在研究院多交代几句，就连夜坐上了前往燕京的飞机。
当他穿越层层值守，来到汇报室时，此时的气氛显得庄重而严肃。
显然，面对此时极其特殊的汇报对象。
陆时羡没有重复过多的技术细节，而是聚焦于他提前做好功课的三个核心论点。
他展示了科尔德斯普林论文中的几张关键图表，与自己团队更早期、但未发表的数据进行了对比。
“领导，诸位专家。对方凭借不正当手段，节省了至少一年半的探索时间。我们现在追赶，靠常规手段已经来不及。他们就像拿着我们绘制的地图在赛跑。唯一的胜算，就是乘坐更先进的交通工具，也就是生物专用超算，实现速度上的绝对超越。”
陆时羡用无比坦诚的语气接着说道：“在生命科学的传统积累、全球人才网络、学术影响力方面，我们与科尔德斯普林这样的百年机构相比，短期内确实存在差距。”
“但是，在计算科学与生命科学的交叉点上，在全球都处于起步阶段时，我们有机会利用国家体制优势，集中力量打造一个他们短期内无法复制的‘生物专用超算’战略武器。这将是一个强大的‘非对称’优势，足以抵消我们在其他方面的部分劣势，甚至能反过来吸引全球顶尖人才向我们靠拢。”
他引用了艾伯茨教授提到的“设计生物学”未来，并进一步延伸：“这台超算，不仅是解开‘枢纽蛋白’之谜的钥匙。它将是未来生物医药研发、智慧农业、生物安全乃至生物制造的核心引擎。”
“它承载的是我国在即将到来的‘生物世纪’中，能否掌握战略主动权的问题。其产出，将是关乎国计民生和国家安全的关键技术平台。”
汇报结束后，现场陷入了长时间的沉思。
领导没有询问具体的技术参数或预算数字，而是问了一个看似简单的问题：
“陆院士，如果国家现在全力支持你，你需要多久，能让这台‘方舟’，展现出足以让今天所有质疑者闭嘴的、决定性的能力？”
陆时羡深吸一口气，迎向领导的目光，很快给出了一个掷地有声的回答。
“只要‘方舟’的第一期原型系统建成并交付使用，六个月内，我向您保证，您将看到它在‘枢纽蛋白’项目上，产出让国际学界无法忽视、甚至颠覆现有认知的成果。如果做不到，我自愿接受任何后果。”
这份基于对科学问题深刻理解和团队能力的绝对自信，成为了打破僵局的最后一击。
领导最终拍板，语气沉稳而有力。
“科技竞争，如同打仗，机会稍纵即逝。我们不能因为存在风险、存在困难，就畏缩不前，眼睁睁看着别人的飞机大炮轰过来，我们还在讨论要不要造更好的步枪。”
“陆时羡院士和他的团队，是国家宝贵的战略科技力量。他们在前沿领域为我们开辟了阵地，遇到了困难，国家必须成为他们最坚实的后盾！”
他在批示上如是写道：“‘方舟’计划，意义重大，时机紧迫。各部门必须打破藩篱，特事特办。”
决策层的定调，如同一声发令枪，瞬间打破了所有的推诿和扯皮。
原本在各部门间流转的文件被迅速签署，预算在优先保障下得以落实，顶尖的技术专家和工程师从全国各地被抽调组建核心团队。
一份高度保密的红头文件悄然间下发，其主要内容大概是：
一是建立“华国生物计算平台建设专项领导小组”。
由一位分管领导亲自挂帅，发改部门、科技部门、工信部门、华科院、财政部门的主要领导参与，统筹协调，强力推进。
二是启动“华国生物计算平台一期工程”，计划采用“成熟先行、分步实施”策略。
优先研发和部署那些技术相对成熟、但对生命科学关键问题能产生立竿见影效果的异构加速单元和软件栈。选址初步定在长三角生态绿色一体化发展示范区，毗邻繁缕研究院，以实现最优协同。
三是开辟“绿色通道”，在预算审批、土地征用、人才引进、设备采购等方面给予最大限度的政策支持和灵活性，确保项目以最快速度落地。
四是给予繁缕研究院“国家生物计算前沿创新中心”的资质和配套支持，使其成为“方舟”超算的首席应用单位和核心研发伙伴，确保国家重器能够精准服务于最前沿的科学探索。
仅仅在这场会议后的第一周，关于“华国生物计算平台一期工程”正式立项的红头文件便已下达。
位于长三角的选址地点，前期准备工作则以惊人的效率展开。