萧宇退出皇权争夺，陷害他的二皇子却并没有那般轻易便夺得储君之位，剩余的几位皇子如闻见了腥味的猫，纷纷卷入了皇权之争，一年时间，朝野动荡，相争的皇子们残的残，死的死，二皇子终是登上了储君之位，可这结果却并非所有人都喜闻乐见的。
玄机门，乃是由炎国开国皇帝萧启所创的一方净土，本是为怀缅曾经家乡，为那些淡泊名利只求退隐的曾经一起打天下的兄弟们所设，但在萧启死后，世家卷土重来，国君暴毙，新君尚未成年，边关又逢敌国入侵，炎国开国不过刚经三任皇帝便面临着灭国之危。
危机之时，玄机门出世，被萧启送到玄机门的第九子萧玉清带领玄机门人退去敌兵，更是运筹帷幄，逼得世家不得不妥协收减势力，十年时间，攘外夷，定朝局。
萧玉清的存在让玄机门封了神，他生前是炎国国师，在他死后，历任玄机门门主同时也是炎国国师，玄机门轻易不出世，但若逢国君不仁，生灵涂炭，或大炎边关面临危机，有着灭国之危时玄机门便总会如神一般，出世瓦解危机，废暴君，立新君，稳定朝局……这成为了炎国君民都知道的铁则。
也正因此，萧氏江山方才传承了一千三百余年，无论其间经历多少风雨，最后都稳固屹立。
先帝的二皇子性情阴戾，做事不折手段，更是置黎民百姓于不顾，为夺取储君之位勾结外敌，通敌卖国，甘愿割地给外夷，出卖军情，害得二十万大军全军覆没，如此视本国军民生死为无物的君主炎国自然不能要。
因此玄机门门主玄壬找到了萧宇，要扶持他重新回到皇权中心，废去二皇子与先帝，助他登上帝位。
被爱人背叛，父亲废弃，手足相残，萧宇对深宫是失望了的，若是不出变故，他或许便真的会隐姓埋名，就在山林中了此一生，但玄壬国师提醒了他，天下苍生，黎民百姓是他所割舍不掉的责任，因为他是皇族，因他生来便是太子，更何况，他的妻妾子女都还在京城之中。
沈清许想过很多次他会回去，或者他在某一天被发现，别的皇子会派人来刺杀他，但在假想的未来中，她却从未想过他们会分开。
皇权之争复杂，萧宇怕她遭遇不测，所以不愿将她卷入其中，无论她怎么痴缠撒娇，他都不肯带她同去，而此时，她体内的毒素也积累到一定程度，迎来了第一次毒发。
然后，萧宇与玄壬国师回京，她则被带往玄机门，因为毒发昏迷，她都没来得及与他道别。
玄机门是一个十分特殊的地方，那里不讲世俗，人人平等，没有那么多的恶意与埋怨，而是一处十分祥和的清净地。
相比世俗而言，玄机门就像是一个仙境。
在那里，她学到了很多东西，懂得了很多道理，这些道理的领会，让她有如醍醐灌顶，她开始疯狂吸取玄机门的各种知识，如同一块吸水的海绵，拼命将知识收揽其中。
然后在觉得自己学有所成后，如同别的玄机门弟子那般，隐姓埋名，下山历练，她本是准备游历一番便去京中看他的，他之前便曾来信说要接她回去，只是那时她正忙于学业，加之回京会面临身份问题和沈舟一家便回绝了。
而这一次，她同样没能去成，江县瘟疫，闹得极大，谣言纷起，甚至危及皇权，她正逢游历在附近，便去与玄机门所属的医仙谷弟子会合，参与诊治。
好不容易将瘟疫处理好，玄机门那边却是八百里加急急召，匆忙赶回，门主中毒身亡，原本培养的继承人早已因违反门规自请被逐出山门，她临危受命，成了新一代的玄机门门主。
也是在此时，她才知玄机门与皇室之间的紧张关系甚至是已到了剑跋扈张的地步，玄壬门主所中的是暗部的毒药，而暗部，是独属于炎国帝王的。
恰逢此时，她与医圣都不在玄机门，玄壬门主的毒便一拖再拖，拖到最后已是毒入肺腑，无药可解。
纵然是她比从前功用更强的眼泪，对上那暗部剧毒也只能是延长毒发时间，却解不了毒，因为毒性已经蔓延全身了。
玄机门与皇族的关系本就紧张，门主还死于暗部剧毒，这无疑是两方之间宣战的导火线，但玄机门守护萧氏王朝千年，对萧氏的感情，只怕是比某些任性的帝王还深。
若非被逼到极致，玄机门是绝不愿与皇族为敌的，废一个帝王说起来容易，但其间耗费的人力物力却没有那么简单，而且玄机门其实一直在被历代帝王暗中打压，真正全心信赖玄机门的帝王少得可怜，到得先帝之时，玄机门其实早已衰弱。
助萧宇登上帝位，更是让玄机门资源损耗不少，与皇室为敌，不是明智之选。
因此，他选中了沈清许，将门主之位传于她，他相信自己的小徒弟，也相信宗门的教导会让小徒弟做出正确的抉择，同时，也是寄希望于沈清许曾与萧宇之间那点共患难的情谊，到了危机关头，奢望这点情谊能让帝王动容，对玄机门网开一面。
对于玄壬门主的决定，沈清许是庆幸和无奈的，她从八岁便来到玄机门，在玄机门长大，最后更是成为门主，没人会比她更了解玄机门，玄机门真的只是一方简单的净土，祥和安乐，没什么权位利益之争，也绝无窥视皇权的野心。
玄机门只是简单的在执行着先辈们的遗愿，第一任玄机门门主萧玉清不愿看到父亲辛苦创下的基业被毁；第一任玄机门众门人不愿看到曾经拼死打下的江山被毁于一旦；而玄机门历代门人，也不愿看到炎国起战火，不愿看到百姓生灵涂炭。
对于曾经被萧宇从水中救起，与他朝夕相处过一年的沈清许来说，她是不信萧宇会如此做的，纵然是他亲自下令做了这样的事，想必也应是其间有着什么误会。
然而，作为玄机门门主，作为玄机门的一员，她却是不能这般简单的去相信，因为她身后，是玄机门千年基业，是玄机门数万门人。